MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014012	TA	3	6	20	25	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014012	TAT	3	9	33	41	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014012	TCT	2	6	59	64	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014012	T	6	6	77	82	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014012	TAT	2	6	87	92	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014012	GCG	2	6	103	108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014012	TTA	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014012	GATCT	2	10	195	204	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014012	ATA	2	6	234	239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014012	AG	3	6	264	269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014012	TCT	2	6	377	382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138772
12	NC_014012	GT	3	6	604	609	0 %	50 %	50 %	0 %	294138772
13	NC_014012	AGA	2	6	610	615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138772
14	NC_014012	TCG	2	6	713	718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138772
15	NC_014012	CTA	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138772
16	NC_014012	TACT	2	8	787	794	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014012	TTAT	2	8	805	812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014012	GAT	2	6	863	868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014012	TA	3	6	1113	1118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014012	ATT	2	6	1242	1247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138773
21	NC_014012	AGCT	2	8	1291	1298	25 %	25 %	25 %	25 %	294138773
22	NC_014012	ATA	2	6	1350	1355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014012	TTA	2	6	1453	1458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138774
24	NC_014012	CGA	2	6	1469	1474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138774
25	NC_014012	AT	3	6	1531	1536	50 %	50 %	0 %	0 %	294138774
26	NC_014012	TGAG	2	8	1537	1544	25 %	25 %	50 %	0 %	294138774
27	NC_014012	ATC	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138774
28	NC_014012	TGCT	2	8	1666	1673	0 %	50 %	25 %	25 %	294138774
29	NC_014012	GCG	2	6	1698	1703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138774
30	NC_014012	GGT	2	6	1761	1766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138774
31	NC_014012	AGA	2	6	1780	1785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138774
32	NC_014012	CAG	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138774
33	NC_014012	GGT	2	6	1943	1948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138774
34	NC_014012	T	6	6	2037	2042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014012	GA	3	6	2069	2074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014012	TAA	2	6	2095	2100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014012	TCT	2	6	2142	2147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014012	GTT	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138775
39	NC_014012	TTA	2	6	2214	2219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138775
40	NC_014012	TGG	2	6	2256	2261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138775
41	NC_014012	CGA	2	6	2294	2299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138775
42	NC_014012	TTTCG	2	10	2379	2388	0 %	60 %	20 %	20 %	294138775
43	NC_014012	TGG	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138775
44	NC_014012	GAGT	2	8	2501	2508	25 %	25 %	50 %	0 %	294138775
45	NC_014012	CAG	2	6	2553	2558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138775
46	NC_014012	TGT	2	6	2857	2862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138775
47	NC_014012	GAG	2	6	2865	2870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138775
48	NC_014012	GTG	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138775
49	NC_014012	GCC	2	6	3027	3032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138775
50	NC_014012	AAT	2	6	3042	3047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138775
51	NC_014012	CCTG	2	8	3093	3100	0 %	25 %	25 %	50 %	294138775
52	NC_014012	TAT	2	6	3123	3128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138775
53	NC_014012	CCA	2	6	3149	3154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138775
54	NC_014012	CAG	2	6	3171	3176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138775
55	NC_014012	TA	3	6	3234	3239	50 %	50 %	0 %	0 %	294138775
56	NC_014012	TC	3	6	3262	3267	0 %	50 %	0 %	50 %	294138775
57	NC_014012	GCG	2	6	3270	3275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138775
58	NC_014012	ACA	2	6	3398	3403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138775
59	NC_014012	GAT	2	6	3485	3490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138775
60	NC_014012	ATG	2	6	3492	3497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138775
61	NC_014012	ATC	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138775
62	NC_014012	AG	3	6	3597	3602	50 %	0 %	50 %	0 %	294138775
63	NC_014012	AGG	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138775
64	NC_014012	CAT	2	6	3704	3709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138776
65	NC_014012	CCA	2	6	3711	3716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
66	NC_014012	TA	3	6	3731	3736	50 %	50 %	0 %	0 %	294138776
67	NC_014012	CT	3	6	3783	3788	0 %	50 %	0 %	50 %	294138776
68	NC_014012	ATG	2	6	3821	3826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
69	NC_014012	CAG	2	6	3871	3876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138776
70	NC_014012	CATG	2	8	3895	3902	25 %	25 %	25 %	25 %	294138776
71	NC_014012	ATCT	2	8	3917	3924	25 %	50 %	0 %	25 %	294138776
72	NC_014012	CGG	2	6	3943	3948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138776
73	NC_014012	ATT	2	6	3957	3962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138776
74	NC_014012	TGG	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138776
75	NC_014012	CTG	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138776
76	NC_014012	TTC	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138776
77	NC_014012	GCTG	2	8	4091	4098	0 %	25 %	50 %	25 %	294138776
78	NC_014012	ATG	2	6	4143	4148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
79	NC_014012	CAT	2	6	4153	4158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138776
80	NC_014012	CAC	2	6	4222	4227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
81	NC_014012	CAT	2	6	4345	4350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138776
82	NC_014012	GAT	2	6	4351	4356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
83	NC_014012	CTT	2	6	4381	4386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138776
84	NC_014012	CGG	2	6	4429	4434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138776
85	NC_014012	ATG	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
86	NC_014012	TGT	2	6	4609	4614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138776
87	NC_014012	CAC	2	6	4622	4627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
88	NC_014012	ATGT	2	8	4628	4635	25 %	50 %	25 %	0 %	294138776
89	NC_014012	TCT	2	6	4662	4667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138776
90	NC_014012	CCA	3	9	4671	4679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
91	NC_014012	ATG	2	6	4766	4771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
92	NC_014012	CGG	2	6	4804	4809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138776
93	NC_014012	TGG	2	6	4836	4841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138776
94	NC_014012	TGG	2	6	4872	4877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138776
95	NC_014012	CGC	2	6	4924	4929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138776
96	NC_014012	CAT	2	6	5185	5190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138776
97	NC_014012	AAG	2	6	5210	5215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138776
98	NC_014012	CCA	2	6	5238	5243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
99	NC_014012	G	6	6	5289	5294	0 %	0 %	100 %	0 %	294138776
100	NC_014012	GAT	2	6	5392	5397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
101	NC_014012	ACC	2	6	5443	5448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
102	NC_014012	GAT	2	6	5459	5464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
103	NC_014012	GAG	2	6	5469	5474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138776
104	NC_014012	TGA	2	6	5477	5482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
105	NC_014012	GCA	2	6	5542	5547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138777
106	NC_014012	T	6	6	5605	5610	0 %	100 %	0 %	0 %	294138777
107	NC_014012	TCT	2	6	5630	5635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138777
108	NC_014012	CTGG	2	8	5689	5696	0 %	25 %	50 %	25 %	294138777
109	NC_014012	GCT	2	6	5747	5752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138777
110	NC_014012	TGT	2	6	5753	5758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138777
111	NC_014012	GTGA	2	8	5794	5801	25 %	25 %	50 %	0 %	294138777
112	NC_014012	CTG	2	6	5827	5832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138777
113	NC_014012	TCT	2	6	5846	5851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138777
114	NC_014012	GT	3	6	5879	5884	0 %	50 %	50 %	0 %	294138777
115	NC_014012	GGC	2	6	5980	5985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138777
116	NC_014012	AT	3	6	6038	6043	50 %	50 %	0 %	0 %	294138777
117	NC_014012	GCT	2	6	6090	6095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138777
118	NC_014012	GAT	2	6	6178	6183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014012	GAGT	2	8	6229	6236	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014012	GAT	2	6	6251	6256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138778
121	NC_014012	AGC	3	9	6268	6276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138778
122	NC_014012	GAT	2	6	6290	6295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138778
123	NC_014012	GTGA	2	8	6308	6315	25 %	25 %	50 %	0 %	294138778
124	NC_014012	TGA	2	6	6360	6365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138778
125	NC_014012	CAT	2	6	6494	6499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138778
126	NC_014012	AAT	2	6	6520	6525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138778
127	NC_014012	ATGGCG	2	12	6557	6568	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294138778
128	NC_014012	TCG	2	6	6645	6650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138778
129	NC_014012	AGG	2	6	6687	6692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138778
130	NC_014012	CTT	2	6	6742	6747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138778
131	NC_014012	CCG	2	6	6780	6785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138778
132	NC_014012	GCT	2	6	6973	6978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014012	TTGT	2	8	7150	7157	0 %	75 %	25 %	0 %	294138779
134	NC_014012	TGG	2	6	7178	7183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138779
135	NC_014012	ACT	2	6	7184	7189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138779
136	NC_014012	TTAT	2	8	7228	7235	25 %	75 %	0 %	0 %	294138779
137	NC_014012	ATC	2	6	7255	7260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138779
138	NC_014012	GTT	2	6	7308	7313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138779
139	NC_014012	GTG	2	6	7333	7338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138779
140	NC_014012	TTA	2	6	7340	7345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138779
141	NC_014012	TATTCT	2	12	7426	7437	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_014012	TTAGGG	2	12	7443	7454	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014012	TGC	2	6	7489	7494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138780
144	NC_014012	TAGT	2	8	7555	7562	25 %	50 %	25 %	0 %	294138780
145	NC_014012	CTG	2	6	7623	7628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138780
146	NC_014012	CT	3	6	7644	7649	0 %	50 %	0 %	50 %	294138780
147	NC_014012	ATC	2	6	7666	7671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138780
148	NC_014012	TG	3	6	7748	7753	0 %	50 %	50 %	0 %	294138780
149	NC_014012	T	6	6	7831	7836	0 %	100 %	0 %	0 %	294138780
150	NC_014012	CAGA	2	8	7849	7856	50 %	0 %	25 %	25 %	294138780
151	NC_014012	TAG	2	6	7991	7996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138780
152	NC_014012	ATCT	2	8	8043	8050	25 %	50 %	0 %	25 %	294138780
153	NC_014012	GAT	2	6	8127	8132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138780
154	NC_014012	TAA	2	6	8204	8209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014012	ATG	2	6	8230	8235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014012	AT	3	6	8288	8293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014012	GCA	2	6	8294	8299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_014012	ACA	2	6	8329	8334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138781
159	NC_014012	AAT	2	6	8337	8342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138781
160	NC_014012	GAT	2	6	8365	8370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138781
161	NC_014012	ATC	2	6	8380	8385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138781
162	NC_014012	TG	3	6	8428	8433	0 %	50 %	50 %	0 %	294138781
163	NC_014012	CCA	2	6	8444	8449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138781
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172	NC_014012	GAT	2	6	8959	8964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138781
173	NC_014012	CTA	2	6	9003	9008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138781
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175	NC_014012	AT	3	6	9180	9185	50 %	50 %	0 %	0 %	294138781
176	NC_014012	ATG	2	6	9188	9193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138781
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180	NC_014012	GCGGG	2	10	9307	9316	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
181	NC_014012	TTAG	2	8	9379	9386	25 %	50 %	25 %	0 %	294138782
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197	NC_014012	CGG	2	6	10049	10054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
198	NC_014012	T	7	7	10096	10102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_014012	TTA	2	6	10115	10120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_014012	T	8	8	10258	10265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_014012	TAT	2	6	10272	10277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
204	NC_014012	TCA	2	6	10278	10283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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209	NC_014012	ATTA	2	8	10498	10505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
210	NC_014012	TCT	2	6	10512	10517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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213	NC_014012	A	7	7	10710	10716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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227	NC_014012	ACC	2	6	11495	11500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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229	NC_014012	TTC	2	6	11648	11653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138784
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231	NC_014012	ATCG	2	8	11669	11676	25 %	25 %	25 %	25 %	294138784
232	NC_014012	TAG	2	6	11686	11691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138784
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250	NC_014012	CAA	2	6	12440	12445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138785
251	NC_014012	TAA	2	6	12581	12586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138785
252	NC_014012	TTG	3	9	12618	12626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138785
253	NC_014012	CAT	2	6	12730	12735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138786
254	NC_014012	AGTA	2	8	12786	12793	50 %	25 %	25 %	0 %	294138786
255	NC_014012	TTTC	2	8	12799	12806	0 %	75 %	0 %	25 %	294138786
256	NC_014012	GAC	2	6	12836	12841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138786
257	NC_014012	ACG	2	6	12854	12859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138786
258	NC_014012	CAG	2	6	12868	12873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138786
259	NC_014012	CTT	2	6	12918	12923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138786
260	NC_014012	CA	3	6	13049	13054	50 %	0 %	0 %	50 %	294138787
261	NC_014012	T	6	6	13115	13120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_014012	GTTTG	2	10	13154	13163	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
263	NC_014012	CCAT	2	8	13245	13252	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
264	NC_014012	CCTA	2	8	13294	13301	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
265	NC_014012	TGC	2	6	13361	13366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138788
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267	NC_014012	T	6	6	13526	13531	0 %	100 %	0 %	0 %	294138788
268	NC_014012	CGT	2	6	13643	13648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138788
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270	NC_014012	CT	3	6	13706	13711	0 %	50 %	0 %	50 %	294138788
271	NC_014012	CCT	2	6	13761	13766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294138788
272	NC_014012	TTA	2	6	13857	13862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138788
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323	NC_014012	AGTA	2	8	16211	16218	50 %	25 %	25 %	0 %	294138788
324	NC_014012	AATA	2	8	16282	16289	75 %	25 %	0 %	0 %	294138788
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381	NC_014012	TGG	2	6	19887	19892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_014012	CTCA	2	8	20949	20956	25 %	25 %	0 %	50 %	294138793
400	NC_014012	GAA	2	6	20996	21001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138794
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402	NC_014012	TAA	2	6	21059	21064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138794
403	NC_014012	CAAT	2	8	21142	21149	50 %	25 %	0 %	25 %	294138794
404	NC_014012	ACA	2	6	21177	21182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138794
405	NC_014012	ATC	2	6	21235	21240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138794
406	NC_014012	ATA	2	6	21292	21297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138794
407	NC_014012	CTC	2	6	21311	21316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294138794
408	NC_014012	ATA	2	6	21436	21441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138794
409	NC_014012	GCGAA	2	10	21466	21475	40 %	0 %	40 %	20 %	294138794
410	NC_014012	ATA	2	6	21683	21688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_014012	GCT	2	6	21717	21722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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424	NC_014012	GAAG	2	8	22354	22361	50 %	0 %	50 %	0 %	294138795
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431	NC_014012	AT	3	6	22869	22874	50 %	50 %	0 %	0 %	294138795
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